对申请人的作用：有助于其顺利参与各类经济活动。在许多交易中，对方可能要求提供担保以降低风险，申请人通过提供保函，可以满足对方的要求，增强自身在交易中的信用度，从而更容易获得合同、订单等商业机会。
与保证的区别：保证通常是一种人的担保，主要依赖保证人的信用和偿债能力；而保函除了人的担保外，还往往与银行等金融机构的信用和资金实力相关，具有更强的可靠性和独立性。在法律关系上，保证一般是从属于主债权债务关系的从合同，而保函在一定程度上具有独立性，即使基础交易出现问题，只要保函的索赔条件成就，受益人通常仍有权向担保人索赔。
合同约定：预付款保函是为保障基础交易合同中预付款的而设立的，合同双方可根据交易的具体安排和需求，在合同中约定预付款保函的期限。比如在大型设备采购合同中，双方可根据设备生产周期、运输时间等因素，协商确定预付款保函的期限。
预付款金额调整：当预付款金额发生变化，可能影响保函风险和期限合理性，双方可协商调整期限。比如预付款金额增加，受益人可能要求延长保函期限以保障资金。