审批流程方面
审批时间长：银行内部审批流程繁琐，资料审核严格，加上业务繁忙等原因，可能导致保函开具时间过长，错过项目的投标截止日期或影响合同的正常签订。
沟通不畅：企业与银行之间缺乏有效的沟通机制，信息传递不及时或不准确，银行提出的问题或要求企业未能及时响应，企业对审批进度和要求也不了解，会造成审批流程的延误。
费用方面
费用过高：企业对银行收取的保函费用有疑问，觉得费用过高或者收费标准不透明，不同银行的收费标准差异较大，企业可能不清楚费用是如何计算的，增加了财务成本。
费用争议：在保函办理过程中，可能会出现一些额外费用，如加急费、修改费等，企业事先未了解清楚，导致与银行产生费用争议。
小金额保函：对于金额在 10 万元以下的小额保函，银行可能会按固定金额收费，一般在 300 元 - 1000 元左右。如工商银行投标保函手续费 100 元，履约保函和预付款保函手续费 300 元。
大金额保函：通常按保函金额的一定比例收取，比例范围大概在 0.5%-2%。例如保函金额为 100 万元，按 1% 的比例计算，费用就是 1 万元。当保函金额超过一定范围后，收费比例可能会有所下降。
投标保函：风险相对较低，收费一般为保函金额的 0.5%-1%。
履约保函和预付款保函：涉及合同履行和款项支付，风险较高，收费通常为保函金额的 1%-3%。